无害化处理设备消毒工作可不包含罐内，因为罐内工作的时候是一种高温的环境，本身病菌就进行了杀灭所以不需要再进行额外的消毒，当然也要平日里做好相应的清洁工作，注重消毒的地方在无害化处理的罐门处、还有着相应的运输方面，对于物料车等也要做好相应的消毒工作，除此之外对受水淹圈舍、食槽、畜禽用具、运输工具，要进行全面彻底消毒，实际使用的时候每隔一段时间就应该做一次全面的消毒工作，而对于运输车以及相应的暂存点等要经常的进行消毒。
内部易于清洁和维护，带自动切断装置、排油装置和取样口，无害化处理设备采用二级燃烧室设计，旋转火幕焚烧技术，旋风式除尘，风冷系统，燃烧机性能良好，一次点火率，燃油露化效果好，热效率高，缩短了无害化处理时间和降低处理成本，无害化处理设备对环境的作用，由于该设备用于处理动物尸体，因此它自然处理动物尸体，由于它对环境有很大的影响，我们应该先看一下畜禽尸体对环境的有害影响，如果尸体放置时处理不当，将对环境产生较大的影响。
土壤被覆盖后，消毒液被喷洒在掩埋区域周围，焚烧处理，焚烧处理一般用于畜牧业（如猪、牛、羊等），这种方法比较适合于规模化养殖场等企业处理死畜，对于附近没有垃圾焚烧厂的农场或小农户，可自行建造小型焚烧炉，用沼气、木柴等生态燃料焚烧死畜，但应安装炉盖和废气管道，并在排气口安装简易喷淋装置，以净化废气，此外，焚烧炉应建在远离水源和居民区的空地上，并建在居民区的背风面上，禽畜无害化处理设备按我国锅炉压力容器标准制造，具有良好的耐腐蚀和承压性能。