混合氨基酸一般在树脂上分离纯氨基酸组分，其分离原理是基于树脂对不同氨基酸的选择性。选择性大小的顺序为：碱性氨基酸＞中性氨基酸＞酸性氨基酸。当解吸时，氨基酸流出顺序正好相反，酸性氨基酸.先流出树脂柱。决定氨基酸流出顺序的另外一个因素是氨基酸侧链的疏水性。
料液中的阳离子含量：由于离子交换树脂催化剂是一种强酸性的阳离子交换剂，它对所有常见的一些阳离子（如钙、镁、钠、钾、铁等）都有较好的选择性，因此，当料液中含有这些离子或人为地带入这些离子时，会迅速的被催化剂中H+所置换，从而使树脂的活性降低。这是导致催化剂失活的.常见和.主要的原因。一般可用保护净化床去除。
这两类树脂的吸附性能都很好，但有不同特点。丙烯酸系树脂能交换吸附大多数离子型色素，脱色容量大，而且吸附物较易洗脱，便于再生，在糖厂中可用作主要的脱色树脂。苯乙烯系树脂擅长吸附芳香族物质，善于吸附糖汁中的多酚类色素（包括带负电的或不带电的）；但在再生时较难洗脱。因此，糖液先用丙烯酸树脂进行粗脱色，再用苯乙烯树脂进行精脱色，可充分发挥两者的长处。