微生物实验室设计根据实验需求进行，普遍可以划分为中心实验室、气体供应室、高温室、仪器室、微生物检查室、留样观察室、办公区域。当企业实验室面积不足，或者实验具有一定的特殊性，就需要专ye微生物实验室设计公司设计人员，根据客户具体情况定制设计方案。
中心实验室作为制药实验室的核心，中心实验室肩负着实验的主要业务责任。气体供应室设置非常必要。因为微生物实验室对环境安全与操作安全要求极高。某些特殊的气体，比如毒室，就需要安全隔离的建造 ，才能满足安全实验的要求。西安维斯通实验室。
高温室主要用于制剂干燥或者消毒。仪器室主要用于各类仪器的存放以及使用，大致可以再细分为天平室、光谱室、显微室、 玻璃仪器存放间和普通仪器室等类别。微生物检查室由于不同的目的的试剂需要的检验环境不同，大致分为：-般无菌室(半无菌室)和卫生标准室两类。
留样观察室主要针对实验室原辅料、包装材料以及成品的留样进行储存验证管理。