温度过低时，玉米种子会遭受冻害，部分或完全丧失发芽能力，第二年播种于田间后，幼苗不能完全或完全出苗。注意提高种子质量，如玉米种子中有较多未成熟或破碎的种子，以及大量的其他尘埃杂质，会给种子的安全储存带来不良后果。在贮藏过程中，一定要注意保持种子的纯度和纯度，严格控制温度，如种子的含水量符合安全水分的要求，种子的成熟度好，能长期忍受较低温度的袭击。
这种种子可以在干燥的冷库中保存很长时间而不影响其发芽能力。如果玉米种子含水量在14%以上，应采取有效的管理措施。要放在温度在零度以上的环境中保存，直到第二年温度都不能低于零度。零度以下的种子可能遭受冻害，失去发芽能力或降低发芽能力。保持通风良好，以免上下漏风或受潮。玉米种子有明显的吸湿性。即使是干燥的种子，当暴露在雨、雪盖或烟雾熏蒸下，也会有回潮现象，也会降低玉米种子的发芽率。所以不要就地堆放，底部一定要防潮，装有种子的麻袋或其他容器要用木头或砖块垫在离地面50cm以上，室内要保持干燥通风。
即使玉米种子经常处于干燥状态，也要经常进行人工通风。对于储存在室外的种子，用盖子盖紧顶部，防止积雪。严禁用塑料袋包装种子，因为塑料袋是不透气的，会使种子与空气隔绝，无法呼吸。同时，种子呼出的一氧化碳也无法排出。时间长了，袋子里的二氧化碳积累过多，造成二氧化碳中毒。另外，种子本身的水分和呼吸产生的热量散发不出去，导致种子发热发霉。不要把种子和农药、氮肥混在一起。