同时，农民有必要优先考虑当地的气候条件，为中药材施肥。在低温干旱季节和地区，农民要注意施用充分腐熟的四川中药材有机肥，提高土壤肥力，保持土壤水分。可使用化学氮肥、磷肥、腐熟有机肥作基肥，有利于幼苗早期生长。
近年来有研究表明，单独施用有机肥并不完全适合各种药用植物。比如在人参、西洋参上涂抹人粪，很容易抑制须根的发育。黄芪施用有机肥的效果不如施用专用复合肥。 在施用有机肥的基础上，化肥的施用原则是:慎用化学氮肥，重视化学磷钾肥的配合，巧施中微量元素肥。比如以花、果为药用药材的中草药植物，要注意磷钾肥的施用；以根和鳞茎为药材的中草药植物，应特别注意钾肥的施用。
提高中药材产量的施肥方法： 种植中药材时，要想增产就要及时施肥。农民在施肥时，应以有机肥为主，化肥为辅，同时均衡施用氮、磷、钾等养分，帮助中药材更好地生长，尤其是在高温多雨的夏季。因为肥料分解快，容易流失，农民要减少养分流失不止一次。 面对花果入药的中药材，要注意磷钾肥的施用；面对根茎类中药材追肥，适当施用钾肥，在中药材根茎膨大期及时追肥，可促进高产优质。中药材施肥总的原则是苗期施氮肥，中后期施磷钾肥。宿根和地下茎药材，整地时施足有机肥。
