依据化学成分主要分为9种：1. 醛类消毒剂1.1甲醛1.2戊二醛1.3邻苯二甲醛 2.杂环类消毒剂 3.含氯消毒剂 4.过氧化物类消毒剂4.1环氧已烷4.2过氧乙酸4.3过氧化氢4.4二氧化氯 5.含碘消毒剂 6.季铵盐类消毒剂6.1单链季铵盐6.2双链季铵盐 7.酚类消毒剂7.1苯酚7.2煤酚皂液（对位、邻位和间位甲酚）7.3卤化酚类（氯苯酚、溴苯酚和对氯间二甲苯酚） 8.胍类消毒剂8.1醋酸氯己定8.2盐酸氯己定8.3葡萄糖酸氯己定8.4聚六甲基双胍8.5聚-2-乙氧基乙基氯化胍8.6聚-6亚甲基二胺氯化胍 9.醇类消毒剂9.175%～80%乙醇溶液9.262%异丙醇溶液9.3含醇消毒凝胶 10.重金属类消毒剂 11. 生物类消毒剂
回到化学消毒剂的发展中，在碘伏被研制的同时，苯酚（石炭酸）通过实验手段合成，1860年，库兴·迈斯特将其用作消毒剂。后来，苯酚被作为一些杀菌剂、防腐剂的合成原料而被广泛使用。随着应用的进一步扩大，它的毒性也被人们进一步认识到，2017年10月27日，苯酚被列入世界卫生组织国际癌症研究机构公布的致癌物清单。 1904年，维尔金指出，甲、乙、丙、丁、戊醇有杀菌作用。1926年，蒂里等观察到，醇类的杀菌作用从甲醇到辛醇逐渐增强。与此同时，更多类型的农业杀菌药剂也相继出现。如1934年，二硫代氨基甲酸衍生物（福美类农药）被研制出。1942年，种子处理剂四氯苯醌，2，3-二氯萘醌问世。1943年，乙撑双二硫代氨基甲酸衍生物（代森类农药）。1952年，含有三氯甲硫基（—SCCI3）的杀菌剂如克菌丹问世，随后又出现了灭菌丹。
20世纪30年代，甲醛的应用在化学消毒发展史上建立了一个里程碑，因此甲醛被誉为第一代化学灭菌剂。醇类也是发现比较早的一类化学消毒剂，如今我们在医院中与生活中常用的酒精消毒，主要成分就是乙醇。1949年，美国菲利普、史密斯等人研究了多种化合物的杀菌作用，发现了环氧乙烷，并且研究了其灭菌条件及影响因素。环氧乙烷被誉为第二代化学灭菌剂。1954年，戴维斯研制成氯己定（洗必泰），它虽然是一种低效消毒剂，但其消毒效果已被公认。 1962年，美国的派普筛选了醛类化合物，发现了戊二醛一经碱化便有良好的杀芽孢作用。此后，一些学者研究了戊二醛的应用条件，杀菌作用及影响因素。这种消毒剂具有广谱、高效、气味小、低毒、对金属腐蚀小的优点。20世纪70年代以来广泛应用于医学灭菌，被称为冷灭菌剂，并被称为第三代化学灭菌剂。
