依据化学成分主要分为9种：1. 醛类消毒剂1.1甲醛1.2戊二醛1.3邻苯二甲醛 2.杂环类消毒剂 3.含氯消毒剂 4.过氧化物类消毒剂4.1环氧已烷4.2过氧乙酸4.3过氧化氢4.4二氧化氯 5.含碘消毒剂 6.季铵盐类消毒剂6.1单链季铵盐6.2双链季铵盐 7.酚类消毒剂7.1苯酚7.2煤酚皂液（对位、邻位和间位甲酚）7.3卤化酚类（氯苯酚、溴苯酚和对氯间二甲苯酚） 8.胍类消毒剂8.1醋酸氯己定8.2盐酸氯己定8.3葡萄糖酸氯己定8.4聚六甲基双胍8.5聚-2-乙氧基乙基氯化胍8.6聚-6亚甲基二胺氯化胍 9.醇类消毒剂9.175%～80%乙醇溶液9.262%异丙醇溶液9.3含醇消毒凝胶 10.重金属类消毒剂 11. 生物类消毒剂
在巴斯德微生物研究基础上更进一步的约瑟夫·李斯特（1827-1912），是英国维多利亚时代的外科医师，也是外科消毒法的创始人及推广者。在他那个年代，医学界普遍缺乏消毒意识，使得当时外科手术的成功率不高，无法得到普遍实行。但是，李斯特经过观察发现，皮肤完好的骨折病人一般不易发生感染，便提出设想，即感染是因为外部因素造成的。18 ** 年4月7日，巴斯德发现微生物的存在，为李斯特的设想提供了理论上的依据。1865年，当时他在格拉斯哥大学担任外科医学教授，首先提出缺乏消毒是手术后发生感染的主要原因。1867年他发表论文公布了这一成果，不到10年就使手术后死亡率从45 %降到 15 %。挽救了亿万人的生命。而其论文中有关外科无菌操作技术的论述，其中大部分原则仍沿用至今。
20世纪30年代，甲醛的应用在化学消毒发展史上建立了一个里程碑，因此甲醛被誉为第一代化学灭菌剂。醇类也是发现比较早的一类化学消毒剂，如今我们在医院中与生活中常用的酒精消毒，主要成分就是乙醇。1949年，美国菲利普、史密斯等人研究了多种化合物的杀菌作用，发现了环氧乙烷，并且研究了其灭菌条件及影响因素。环氧乙烷被誉为第二代化学灭菌剂。1954年，戴维斯研制成氯己定（洗必泰），它虽然是一种低效消毒剂，但其消毒效果已被公认。 1962年，美国的派普筛选了醛类化合物，发现了戊二醛一经碱化便有良好的杀芽孢作用。此后，一些学者研究了戊二醛的应用条件，杀菌作用及影响因素。这种消毒剂具有广谱、高效、气味小、低毒、对金属腐蚀小的优点。20世纪70年代以来广泛应用于医学灭菌，被称为冷灭菌剂，并被称为第三代化学灭菌剂。
