我们一般要选择一些秸秆或者一些粮食下脚料，或者一些油类、豆粕类、花生粕类的含有植物蛋白的这类原料所生产的有机肥，这种有机肥经过高温和无害化处理，本身就有一个很强的螯合作用，进入到土壤以后，能够养活大量的微生物，而且可以直接供给作物营养吸收，同时这些有机质是多种复合酸的合成，可以螯合土壤中大量的元素，所以使用这种有机肥的时候，可以解决土壤一个微环境的问题，同时也能解决作物地上部生长的生理变化问题，并且能够持续的改良土壤，生产出优质的农产品。
生物有机肥也区别于生物菌肥，生物有机肥中主要利用有机养分、有机质，菌肥主要利用含有的菌种、菌株，施生物有机肥的作物主要表现为主茎生长健硕，叶绿量增加，光合效率提高，肥效强，庄稼不易拉秧，采摘期长，高产生物有机肥原理：提高结实率和籽实程度，增加中后期收获量，使作物增产百分之10以上，有机无机复混肥料由有机和无机肥料混合或化合制成，既含有一定比例的有机质，又含有较高的养分，这与我国当前科学施肥所提倡的“有机和无机相结合”的原则是相符的。
就目前有机农业生产来说，首先对于城市垃圾和城市污泥，包括含有一些重金属类的工业化的未经高温或者无害化处理的作为原料的有机肥，我们应该排除在外，有机肥生产工艺主要有完全发酵和半发酵两种，主要看是否经过了高温灭菌过程，然后才能判断是否经过了无害化处理，粉状有机肥的检验方法是，直接把粉状有机肥放在一杯水里，如果是漂浮的，那么就是一个合格的有机肥，如果直接下沉，那么这个有机肥就可能有问题，因为有机质要比水轻。
