猪粪是一种很好的农家肥，据统计，年出栏在千头左右的猪场，每天产猪粪可达1.2吨左右，猪粪含有丰富的氮、磷、钾等养分，而且富含有机质，是培肥改良土壤的有机肥资源。但如果直接施用鲜猪粪便，会产生作物伤根、病害、草害等负面影响。 如果按传统自然发酵，也存在以下几个弊端： 1.堆沤时间长，一般需要4-6个月，气温低时时间更长，而且堆沤发酵效果差； 2.长期堆置既占场地，又对周围环境造成污染； 3.自然堆沤发酵的粪便呈烂湿状、恶臭，难以运输，也很难直接施用； 4.自然堆沤发酵不能很好地清除猪粪里的病原菌、虫卵等有害物质。
自然发酵法很简单，将猪粪混合加入秸秆堆放在一起，浇上水。然后覆盖上塑料薄膜进行自然发酵，这是利用高温，将猪粪中的病菌杀灭。也可以在猪粪中加上多菌灵、福美双等杀菌剂，杀灭病菌。在发酵时，将薄膜和猪粪间保留一点缝隙，使微生物能大量繁殖，促进发酵。 猪粪自然发酵成有机肥的时间较长，一般需要两三个月的时间，等到没有臭味，变成褐色肥料之后，才算发酵完成。如果使用没有完全腐熟的猪粪，可能会出现烧根等肥害，增加病虫害的发生。
猪粪和秸秆混合之后，将混合好的生物菌和玉米面撒到上面，然后浇水，猪粪较干时，可以增加水的用量，猪粪含水量大时，就可以少用水，最后堆闷沤制成有机肥，堆沤的面积和长度不受限制。经过发酵两三天之后，再进行翻一遍。 猪粪发酵时，加上有机肥发酵剂，能节省发酵时间，大概7~10天的时间就能发酵好，适合大量的猪粪处理，发酵速度快，而且还能防止猪粪腐熟不彻底。
