菜园土壤有机质含量低于4%的，有机肥应作基肥连年适量多施用，土壤有机质含量高于5%的菜地，每年作基肥施用的有机肥可适当减少施用量，施用量要适当，有机肥施用量不是越多越好，而是应据情适量施用，有机质含量较高的菜地、产量较低的品种、生育期较短的蔬菜、温度较高的季节和叶菜类等，有机肥的施用量可稍减少些，冬季等低温季栽培大棚蔬菜时，有部分栽培者会施用半腐熟的猪牛粪等有机肥，记住不可让蔬菜的根系直接接触到这种有机肥，肥与根系应隔土保持一定距离，以防发生肥害并烧伤根系。
科学施用有机肥，有机肥zui适合作基肥施用，没经腐熟的有机肥，不要施于蔬菜地中，有机肥宜深施于土壤中，不要施于畦面，以免养分淋溶流失等，菜地翻耙前，先撒施所需的有机肥，后再翻耙1～2次，可高效保持和延长有机肥的肥力，蔬菜定植前，将有机肥埋施于定植沟或穴，用薄土盖肥后再定植，有好的保肥和延长供肥期等作用，猪牛粪等密闭发酵时，前期堆内zui可达60～70℃,加上密闭发酵造成的缺氧和产生的大量有毒气体等，肥中绝大部分病原微生物和害虫、虫卵、杂草种籽等会被杀死。
已发生肥害的蔬菜，受害较轻的，通过采用以上方法，多可得到解救，肥害发生重的蔬菜，是不可逆的，不要解救，要全部拨除，过些天改种其它蔬菜，有机肥区别于化肥，有机肥的原材料主要来源于大自然，可谓是“取之于自然，用之于自然”，营养丰富；而化肥是通过化学制剂合成，可谓“无中生有”，养分单一，什么是有机肥，广义上讲：俗称农家肥，包括以各种动物、植物残体或代谢物为原材料组成，如人畜、秸秆、动物残体、屠宰场废弃物等。
