有机肥可以提高土壤孔隙度、通透性和植物存活率，增加有益菌、土壤微生物和种群。同时，作物根系形成的优势有益菌群可以抑制有害病原菌的繁殖，增强作物的抗逆性和抗病能力，降低重茬作物的病情指数。连续几年的应用可以大大缓解连作障碍。减少环境污染是一种环保肥料，对人、动物、环境安全无毒。
有机肥料主要来源于植物和/或动物，应用于土壤中提供植物营养的含碳物质。它是由生物、动植物废物和植物残渣加工而成，富含有毒有害物质，包括许多有机酸、肽和丰富的营养元素，包括氮、磷和钾。 当前耕地退化面积已占总耕地面积的40%以上。提高粮食产量的两个关键因素是土壤肥力和土壤利用效率。
生物有机肥的应用更加灵活。生物有机肥中氮、磷、钾含量相对较低，一般在5%左右，养分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有机肥可以作为基肥.种肥.追肥施用不会产生任何不利后果。 因此，虽然生物有机肥是一种新型的有机肥，但其应用与传统的有机肥施用差别不大。只要我们注意到这些点，就会有一定的应用效果。
