有机肥可以提高土壤孔隙度、通透性和植物存活率，增加有益菌、土壤微生物和种群。同时，作物根系形成的优势有益菌群可以抑制有害病原菌的繁殖，增强作物的抗逆性和抗病能力，降低重茬作物的病情指数。连续几年的应用可以大大缓解连作障碍。减少环境污染是一种环保肥料，对人、动物、环境安全无毒。
事实上，过量使用有机肥会造成与过量使用化肥相同的危害。表现为农作物根系吸水困难，容易出现烧根黄叶、幼苗僵硬、叶片变形等症状。严重的后果是农作物逐渐收缩干燥。过量应该怎么处理? 1.应加强通风，避免气体损伤的扩散。有机肥料分解过程中产生的氨不会挥发。因此，在重蒸过程中，应增加放气次数和放气时间，以便及时将氨排出棚外，避免气体损伤。 2、增加施肥量，覆根，用水冲洗。 尽量做基肥，深耕后施。改进施肥方法。 一是施用有机肥深施或覆盖土壤，避免肥料撒在地面上，减少肥料流失、浪费和环境污染。
生物有机肥的应用更加灵活。生物有机肥中氮、磷、钾含量相对较低，一般在5%左右，养分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有机肥可以作为基肥.种肥.追肥施用不会产生任何不利后果。 因此，虽然生物有机肥是一种新型的有机肥，但其应用与传统的有机肥施用差别不大。只要我们注意到这些点，就会有一定的应用效果。
