价值是建筑遗产保护的前提，保护的根本目的是保留并延续有价值的历史构件或历史信息。近代建筑有完整的价值评价体系，可以大致分为历史价值、艺术价值、科学价值、文化价值、社会价值，再加上李格尔提出的“情感价值”。而作为建筑外表皮的清水砖墙，在近代建筑价值体系中占据什么位置？有没有自身的独特价值？这是回答“近代建筑清水砖墙到底要保护什么”的关键。艺术价值：与古代建筑不同的是，清水砖墙是近代建筑立面艺术风格的重要装饰和典型特征，在设计之初就会根据不同的建筑风格，结合清水砖墙的特性，选择各种不同的色彩搭配、拼花图案、线脚和灰缝，同时也要受经济财力和建筑材料的制约。从外廊式风格、哥特复兴风格、安妮女王风格，发展到文艺复兴风格、新古典主义风格，再到装饰艺术风格，不同的建筑风格会有不同的清水砖墙砌法、图案和线脚装饰。
要确定清水砖墙的修复目标，即修复所要达到的“程度”，必须要建立在“价值评估—现场勘察—实验室分析—现场试验”等一系列流程的基础上，根据价值评估的结果，参考项目的经费预算、技术的难易程度等，经过综合分析才能决策。这种决策机制可以用来表示。做好历史价值评估，要对建筑的历史演变过程进行深入研究。近代大城市尤其是开埠城市中重要的建筑物一般都会有建筑图纸、历史档案和照片影像，通过查阅档案、报刊杂志、纪念册等，可以深入了解建筑历史演变过程。尤其是要了解清水砖墙的建造历史和修缮历史，厘清清水砖墙的建造年代，表面如有覆盖层的话是什么时候加的，当时覆盖的原因是什么，尤其要注意是否是因为原来的清水砖墙损毁严重而进行的覆盖，那么在去除覆盖层后可能会引起新的病害问题。此外，还必须关注该建筑与重大历史事件或重要历史人物的关联，一般从保护对象的公布名称中就可以看出，要尽可能弄清重大历史事件发生或重要历史人物居住时期，建筑外立面的状况，是否已经有覆盖层。
即便是在近代建筑保护技术方法处于领先的上海，出台“负面清单”也是当务之急。当前在工人中流行一种“满敷砖粉、打磨出底”的修复技术方法，简单清洗砖墙表面后，即采用砖粉盖满整个墙面，然后用角磨机打磨，直到露出老砖砖面，将所有难以去除的“污垢”全部磨去，而原来缺角、风化、剥落的部位因满盖的砖粉而修补平整。这种工法修复后的清水砖墙虽然远观整洁，但近观却造成破坏：一是打磨属于物理清洗方法，不可避免的会损坏原始砖墙的表面，而砖在烧制过程中，表面因温度高而更坚硬，加上表层老化后共同形成了防护层，角磨机会在砖表面留下一圈圈弧形的打磨痕迹，实际上已经破坏了具有保护作用的表层，使得砖面更容易发生风化等新生病害；二是不符合最小干预原则并破坏了岁月价值，所有的砖墙被无差别的打磨掉表面的“污垢”和带“古色”的面层，而且根据规范浅表风化或微小缺角不用修复的部位也会被“过度修复”。但这种工法一来不需要挑选材料进行细致的清洗，二来不用逐块修补砖面的缺角、风化、剥落，能大量节省施工现场的人工，大大节约成本，获取更多的利润，因而在实际工程中广泛使用。这也更加说明出台“负面清单”迫在眉睫。
